GAPS饮食，是在SCD饮食的基础上发展起来的。GAPS饮食的英文全称是Gut and Psychology Syndrome ，英文的直译是：由肠道失调所引发的心理和精神问题综合症的饮食疗法。这个饮食法的宗旨在于
（1）治疗肠漏、
（2）纠正肠道菌群失调、减少肠道有害细菌，
（3）补充富含营养素的食物，从而平衡免疫系统（我们知道人体的免疫系统70%都在肠道里）。
GAPS饮食法，所避免和允许的食物，和SCD是一脉相承的。不同点在于，GAPS饮食法，虽然允许水果和坚果，但认为这些只能少量食用，不能取代主要食物：肉类、骨头汤、动物内脏、海鲜、河鲜、蔬菜（不允许根茎类蔬菜）、蛋黄、发酵蔬菜、自制酸奶（如果病人可以耐受乳制品的话）。
GAPS饮食法分为GAPS基础阶段和GAPS完整阶段，GAPS基础阶段适用于那些肠道紊乱的患者：比如长期腹泻、IBS、严重腹胀、克罗恩症、溃疡性结肠炎，以及大脑功能障碍的病症，诸如自闭症、精神分裂症、躁郁症、抑郁症。如果没有这些问题，而有其他自身免疫病的困扰，想要试试GAPS食疗，可以越过GAPS基础阶段，直接执行GAPS完整阶段。
让我们来看看GAPS基础阶段的食物列表。这一阶段被细分为6个小阶段，每个小阶段大约执行3-6个星期，从容易消化的食物逐渐过渡到不太容易消化的食物。
第一小阶段，只可以吃以下食物：
（1）家庭自制带肉的骨头汤或者鱼汤。使用带肉的骨头，加水炖2.5-3个小时。以鸡汤开始疗程最好。
（2）煮得烂烂的肉和蔬菜汤，蔬菜需要避免含纤维素过多的类型，去掉含纤维太多的杆茎部位。
（3）煮的肉、鱼、贝类、动物肝脏。
（4）煮蔬菜，去掉含纤维太多的杆茎部位。
（5）脂肪：鸡油、鸭油、猪油、椰子油。
（6）益生菌发酵食物：先少量引入，比如先从1-2勺浸泡发酵蔬菜的发酵汁喝起，再很少量地吃发酵蔬菜，一点点慢慢加量。如果对乳制品不敏感，也可以吃自制酸奶或开菲尔，建议先少量食用再慢慢加量。
（7）甘菊茶、生姜茶、薄荷茶、姜黄茶。
（8）加柠檬的过滤水。
（9）生蜂蜜。
第二小阶段，在第一小阶段基础上，添加以下食物：
（1）鸡蛋黄（避免鸡蛋清）。
（2）增加发酵食物的摄入。
（3）鱼肝油。
第三小阶段，在前面的基础上，添加以下食物：
（1）熟了的牛油果；
（2）纯坚果磨成的坚果酱(nut butter)、鸡蛋、南瓜、酥油做成的饼；
（3）坚果酱，比如杏仁酱、核桃酱、花生酱、腰果酱；
（4）炒鸡蛋、煮鸡蛋；
（5）低火油炒20-30分钟的洋葱；
（6）烧熟的、含纤维素高的蔬菜，比如芦笋、大白菜、芹菜；
（7）益生菌补充剂。
第四小阶段，在前面的基础上，添加以下食物：
（1）烤箱烤出来的肉或者煎肉，但不要油炸。
（2）特级初榨橄榄油。
（3）鲜榨蔬菜汁，最开始的时候空腹喝1-3小勺胡萝卜汁，之后可以在胡萝卜里加入生菜、黄瓜、芹菜一起榨汁，并用温水稀释，逐渐加大摄入量。
（4）坚果磨成的粉，可以用来烘焙，最好是使用自家浸泡处理过的坚果/种子，自己加工磨成粉。
第五小阶段，在前面的基础上，添加以下食物：
（1）煮或蒸的苹果，加入椰子油或动物油。
（2）生蔬菜，最开始吃生菜和削皮的黄瓜，再慢慢过渡到胡萝卜、西红柿、洋葱、大白菜。如果你对茄科蔬菜敏感，就不要吃西红柿了。
（3）鲜榨蔬菜水果汁，在第四小阶段里的鲜榨蔬菜汁里，加入鲜榨的苹果汁、菠萝汁、或芒果汁。不要加入橙汁或橘子汁这样的柑橘类水果汁。
第六小阶段，在前面的基础上，添加以下食物：
（1）GAPS允许的生水果：莓类、带黑点的熟香蕉、桃子、橙子、椰子。水果只能在三餐之间吃，不要和三餐一起吃
（2）少量水果干、椰奶、浸泡过的坚果或种子。
（3）慢慢增加生蜂蜜的摄入量。
GAPS基础阶段，不适合怀孕期或哺乳期妇女，也不适合那些严重便秘的病人。严重便秘的病人，建议直接使用GAPS完整阶段。某些病人消化脂肪的能力差、或者有组胺不耐症，这些病人要根据自己的情况来执行。比如患组胺不耐症的病人，就不能大量摄入骨头汤、发酵蔬菜这样的高组胺食物。有皮肤问题的病人，比如湿疹、痤疮、牛皮癣、荨麻疹的病人，建议避免乳制品。
